De Houtrakpolder maakt deel uit van de gronden die door de Amsterdamsche Kanaalmaatschappij in het IJ zijn drooggemaakt bij de aanleg van het Noordzeekanaal. De polder werd oorspronkelijk bemalen door een stoomgemaal, dat in 1920 werd voorzien van een elektromotor. In 1935 moest dit gemaal wijken voor de verbreding van het Noordzeekanaal, en werd enkele tientallen meters verderop een nieuw dieselgemaal gebouwd.