Het gemaal Zuid- en Noordeinderpolder werd gesticht ter vervanging van het uit 1871 daterende poldergemaal Neptunus, dat qua capaciteit niet meer voldeed en aan renovatie toe was. er werd echter gekozen voor de bouw van een geheel nieuw vijzelgemaal, dat in de sluiskolk van de naast het oude gemaal neptunis gelegen Noordeindersluis werd geplaatst. Het nieuwe gemaal kreeg een capaciteit van 120 m3 per minuut en werd in de vorm van een Design & Constructopdracht ontworpen en gebouw door aannemersbedrijf Schouls te Leiden.